一个全身闪红(hong)光的哥斯拉(la)在香(xiang)港(gang)登陆，并把港岛和(he)九龙的繁(fan)荣商(shang)业区破坏後离去。及後东(dong)京(jing)海底队(dui)道亦因为隧(sui)道机(ji)械主轴溶(rong)化不停发(fa)生事故(gu)，原来哥斯拉(la)身上的冷却系(xi)统已破坏，令牠体内(nei)核(he)子分裂快速活性化，并变成一座懂得步(bu)行的核子(zi)厂。同时东(dong)京水族馆(guan)发生谜一样的事件—水族馆(guan)内的鱼被离奇杀害，经研究後发现是一些生活在二亿多年前的地层(ceng)生物—狄(di)斯亚(ya)所造成。在(zai)临海副都心(xin)，自(zi)卫队(dui)派(pai)出冷冻战车(che)迎(ying)战不明生物—狄(di)斯(si)亚及(ji)哥斯拉。此(ci)时哥(ge)斯拉(la)的体温最终到达一千二百度，并可能引发全人类灭亡的核爆(bao)……