本(ben)片讲述(shu)在(zai)1868年航运界传言南海中(zhong)有海怪破(po)坏(huai)船只，各国政府(fu)被迫派遣军舰(jian)维护航(hang)道安全，及调查(cha)海怪真伪。不料调查舰(jian)被(bei)不明怪(guai)物撞沉，只有阿洛亚斯教(jiao)授、助手康索及鱼叉手尼德蓝被(bei)鹦鹉螺核子(zi)潜艇救起(qi)。该船由尼莫舰长指挥，对运载军火(huo)船(chuan)舰均(jun1)予击沉。尼莫敬重(chong)阿洛(luo)亚斯之成就，将其(qi)视为上宾。潜艇要返(fan)回(hui)瓦(wa)康尼亚基地，中途到深海探索海底世界，此处是(shi)该船粮食(shi)之主要来源。教授(shou)为其科技动(dong)力来自海(hai)底貂(diao)殖(zhi)的技术惊叹不已，但尼德蓝(lan)一心想逃跑，却(que)在荒岛(dao)中被食人族逐(zhu)出(chu)。他又查(cha)出基地位置，用瓶子装信向外通知。到达瓦(wa)康(kang)尼岛时，军舰已围(wei)住该基地(di)。尼莫破坏基(ji)地，引起核子(zi)爆炸，尼(ni)莫亦(yi)中弹命危，临死前(qian)将(jiang)鹦鹉螺号(hao)驶入海(hai)底坟(fen)场加以破(po)坏。