哥斯拉突然(ran)從(cong)北極的冰中出(chu)現！哥斯拉擊沉(chen)核潛艇海洋號，更破壞(huai)北(bei)極的軍事基(ji)地後(hou)開(kai)始南下。同樣的(de)時候，在太平洋(yang)製(zhi)藥宣(xuan)傳部，那公司為提(ti)高節(jie)目的收看率打算使用發俄島(dao)上(shang)的(de)魔(mo)神，櫻井和古江的兩名宣傳人員便去了發俄島。他們發(fa)現島上(shang)出現(xian)的魔(mo)神就是金(jin)剛。於是把(ba)他弄暈帶到日本，不久在運送金剛的船遭日本政府攔截，但那時(shi)金剛(gang)突然從(cong)麻醉(zui)中甦醒(xing)，在運輸船上跑出(chu)來，游(you)向日(ri)本，而且更(geng)在(zai)那須高原初次與哥斯拉對決。第1回(hui)合以(yi)哥斯(si)拉的(de)放(fang)射火焰取得勝利，金剛(gang)被(bei)打敗嗎？
　　同時(shi)自衛隊正(zheng)進(jin)行「火焰攻擊大(da)作戰」，把汽油倒(dao)入河中然後燃點(dian)著火，哥斯拉竟然沒有直接(jie)渡(du)過河(he)流。不過哥斯拉(la)在(zai)高(gao)壓電流前竟不(bu)能突(tu)破，還被嚇走了。
　　另一方面，逃走了的金剛面對阻擋哥(ge)斯(si)拉的電塔(ta)竟輕易被他突破(po)，而(er)且在(zai)發瘋(feng)地吃(chi)著美味的電流，金剛終於到達市(shi)中心(xin)，更捉(zhuo)了櫻井的妹妹(mei)作(zuo)為(wei)人質登上(shang)國會會議廳，自衛隊便利用法(fa)羅島體細(xi)胞(bao)莓汁展開(kai)「美味果汁迷迷糊糊大(da)作(zuo)戰」莓汁從天而降(jiang)，在(zai)空中爆炸灑落(luo)在金剛身上，令金剛暈倒了。
　　自(zi)衛隊防(fang)止金剛破壞城市(shi)，又展開「氣球輸送大作戰」，大氣球綁(bang)在金剛身上，帶著牠(tuo)往富(fu)士地(di)區(qu)，被運送到富士高原的金剛，與(yu)哥斯(si)拉再次決鬥，哥斯拉再把(ba)金剛打倒，更(geng)放出放射(she)火(huo)焰(yan)令森林(lin)著(zhe)火。幸(xing)好有(you)股(gu)雷暴經(jing)過，閃電擊中(zhong)金剛，電流被吸(xi)進金剛(gang)身體中，令他醒來，變成超(chao)級撒亞人般。
　　金剛再戰哥斯(si)拉，金剛使(shi)出雷擊拳，雙手找(zhao)著哥(ge)斯拉(la)的尾巴，然後(hou)三百六十度(du)一(yi)轉把哥斯拉拋到另一處再戰，把熱海城徹底破壞，最後2頭怪(guai)獸更(geng)滾下山跌入海中。不久在(zai)海上只(zhi)看到(dao)金剛的身影，哥斯拉被打(da)敗了。
　　其實東寶(bao)為了不想得罪美國，在(zai)故事中(zhong)，哥(ge)斯拉是被(bei)打(da)敗，但為鞏固哥斯拉(la)在日本
　　怪獸王的地位，卻(que)在官網寫(xie)成平手！哥斯拉和金剛共戰3場(chang)，富士(shi)山(shan)1敗，電塔1勝，熱海(hai)城(cheng)1勝。