工藤新(xin)一是全国著(zhe)名的(de)高(gao)中生侦探，在一次追(zhui)查黑衣人犯(fan)罪团伙时不幸被团伙成员(yuan)发现，击晕后喂(wei)了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xin)一(yi)找到了经常(chang)帮助他的(de)阿笠博士，博士(shi)为他度身打(da)造不少间谍武器(qi)。为了防止犯罪(zui)团伙对他进行(hang)报复，新(xin)一决定隐姓埋名(ming)，暗(an)中(zhong)追查(cha)他们，希望能(neng)得(de)到(dao)解药。一日，新(xin)一(yi) 的女(nv)友毛(mao)利兰来到了阿(a)笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuang)见的新一(yi)情急之下编造了(le)自己名(ming)叫江(jiang)户川柯南(nan)，随后柯(ke)南寄居在了小兰家。小(xiao)兰的父亲毛(mao)利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和(he)他(ta)一(yi)起四出(chu)办案一起追查(cha)黑夜人的下落。柯南在小学认识(shi)步美(mei)等小学生，他们一起组(zu)织了(le)一(yi)个(ge)少年侦探团，向罪犯宣战！