故事(shi)发生在遥(yao)远的(de)未(wei)来，肆虐的异生兽给人(ren)类的安全带来了巨大(da)的困扰，为(wei)了(le)抵挡异(yi)兽的进攻，日本政府成立了防卫组织(zhi)TLT，其中，夜袭(xi)队拥有着最强大(da)的实(shi)力和(he)最强劲(jin)的武器，是整个组织(zhi)内部的中坚力(li)量。                                    
                               　　然而，面对经过了进化(hua)的新(xin)型(xing)异生兽，夜袭队亦束手无策，在这个节骨眼上，光之(zhi)巨人奈克瑟(se)斯奥(ao)特曼和(he)它的适能者姫(zhen)矢准（桐(tong)岛优介(jie) 饰）出现(xian)了。在奈克瑟斯(si)奥特(te)曼创(chuang)造出(chu)的美塔(ta)领域中，奥特曼和异(yi)兽(shou)之间(jian)展开(kai)了激烈的斗争。孤门一辉（川久保拓司 饰）是TLT里的新进成员，当他目睹了奈克瑟斯奥特曼强大的(de)力(li)量后(hou)，开(kai)始对奥特曼的(de)起源和姬矢准的神(shen)秘过往(wang)产生了兴(xing)趣。